В 1624 г. в Брандисе Коменский познакомился с дочерью епископа Марией-Доротеей и женился на ней. До брака Доротея принимала участие в тайной работе общины братьев, а связав свою судьбу с Коменским, стала одним из активных деятелей этого движения.

Весной 1625 г. Коменского отправляют в Польшу для выяснения возможности прибежища чехам в этой стране. По возвращении Коменский ведет пропаганду об освобождении отечества.

Летом 1626 г. Коменский с женой и тестем укрываются в Северо-Восточной Чехии, в Биле-Тржемешне в замке чешского помещика Иржи Садовского. Здесь он пишет дидактическую работу на чешском языке, которая определила круг основных вопросов дидактики и их решение в «Великой дидактике».

31 июля 1627 г. император Фердинанд II провозгласил католичство официальной религией. В указе протестантам предлагалось поменять религию или покинуть Чехию. Многим патриотам пришлось оставить родину и перебраться в Польшу.

8 февраля 1628 г. Коменский поселился в польском городе Лешно, который издавна служил убежищем для «Чешских братьев».

В Польше в общей сумме Коменский проводит 28 лет.

Сразу после переезда Коменский стал преподавать в гимназии «братьев»

естествоведческие предметы, а в 1635 г. его избирают на должность ректора гимназии.

В эти годы Коменский проводит большую работу по усовершенствованию “Великой дидактики”, которую завершает в 1632 году.

Паралельно с работой над «Великой дидактикой»Коменский пишет учебник латинского языка «Открытая дверь языков и всех наук»

, который произвел переворот в системе преподавания этого важного предмета.

В 1633-1638 гг. Коменский продолжает работу над «Великой дидактикой»

и решает издать ее на латинском языке, чтобы она была доступна для всех народов. Но сначала он отправляет рукопись своему другу Иоахиму Гюбнеру, попросив его высказать свое мнение об этой работе. Получив отрицательный отзыв Коменский долгое время воздерживался от издания «Великой дидактики».

Только спустя 20 лет она была опубликована в Амстердаме в полном собрании дидактических сочинений. Эта классическая работа Коменского - основополагающий труд научной педагогики и она перевдена пости на все языки мира.

Помимо этого в Лешно Коменский пишет работы по естествознанию и начинает планировать «Пансофию».Интересно отметить тот факт, что об этой разработке узнал один английский меценат, крупный коммерсант и к тому же образованный человек Самуэл Гартлиб и обратился к Коменскому с письмом, в котором послал некоторую сумму денег и просил его написать «Пансофию»

и заранее прислать ему план этой работы. Коменский составил план “Пансофии” и выслал его в Лондон.

Гартлибу очень понравился замысел «Пансофии»,

и он без ведома автора издал этот план в Лондоне в 1637 г. под названием «Введение к опытам Коменского».Вторично эта книга была напечатана через два года под названием «Предвестник пансофии».

Эта работа Коменского получила широкий отклик как среди выдающихся мыслителей Европы того времени, так и среди государственных деятелей.

В Лешно Коменский также создает философско-психологическую работу «Кузнец счастья, или Искусство советовать самому себе»

, пишет учебник «Геометрия»

, научную работу «Восход и заход главных звезд от восьмого небесного собрания»,

учебную книгу «Краткая космография»,

«Первейшую философию»,